Lembaga Amil Zakat – Sekolah Alam Indonesia adalah salah satu elemen penggerak komunitas di lingkup SAI yang mengemban tugas menghimpun dan mengelola zakat, infak, sedekah, serta dana sosial lain dari komunitas SAI dengan prioritas pemanfaatan pada pemenuhan kebutuhan aspek pendidikan non-KBM, pengembangan sosial kemasyarakatan komunitas SAI dan warga sekitar lingkungan SAI, serta pertisipasi dalam bantuan sosial bencana.